超入門! すべての医療従事者のためのRStudioではじめる医療統計

サンプルデータでらくらくマスター

この頁は『超入門! すべての医療従事者のためのRStudioではじめる医療統計 サンプルデータでらくらくマスター』のフォローアップ、著者によるセミナーのお知らせ、正誤表などを掲載します。

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本書の特徴

無料で、一番長く使える統計ソフトRのわかりやすいマニュアル

臨床研究をはじめるにあたって、統計学の知識は必須です。おそらくあなたは既に統計学のスタンダードな教科書、あるいは「わかりやすい」を謳った参考書などを既に手にしていることでしょう。後者であれば、もしかしたら統計ソフトのマニュアルもついているかもしれません。

どんなソフトであっても簡単な統計処理はできるので、最初にやってみたらと言われるような2群の比較や相関の分析程度ならそれで用は足りるでしょう。しかし、もしあなたがt検定やU検定だけでなく、将来的に高度な疫学やリアルワールドデータをつかった疑似実験(リアルワールドデータ臨床研究)をしようと思っているのなら一番有力な解決策はR言語を最初から覚えてしまうことです。なぜならRは無料なので、あなたが所属している機関が高額な統計ソフトを買ってくれなくても絶対に使え、かつ極めて高度な、最新の統計解析であっても、有志によって開発されたパッケージによって、スムーズに分析する手立てがあるからです。

しかしそんなRにもすっぴんのままでは弱点があります。操作法や利用法があまり直感的ではないのです。じつは、いわゆるデータサイエンティストと呼ばれる高度な統計解析に習熟している人であってもめったに素っぴんのRは使いません。

RのヘビーユーザーたちはRStudioというソフトを介してRによる分析を行うのが主流なのです。RStudioはR言語のIDE(開発環境)です。エディタ,コンソール、グラフなどを1つの画面内で確認できるほか、データ分析プロジェクトを進めるために役立つ機能が豊富に用意されています。

本書はRStudioの基本的な機能を解説したあとに,臨床研究のワークフローを一通り解説していきます。パッケージの準備(3章)、データの整形(5章)、可視化(7章)、具体的な分析(8章~)など、臨床研究に欠かせないこれらの要素の基礎を押さえることができます。

本書では入力すべきコマンドを示すだけでなく、実際の出力結果もきちんと提示しているので、個々の操作がうまく行っているかR初心者にわかりやすい形式となっています。

こんな方におすすめ

臨床医、看護師など臨床研究を始めようとしている方。臨床研究はすでに経験があるが、Rの使い方がわからないかた

こんな方には別の本を

  • まったくの統計学の初心者で統計学の本を一冊も持っていないのなら

    → 金芳堂の統計学

  • 研究論文の統計学的な記述について確認したいのなら

  • → 金芳堂の統計学

目次

  • Part 1
    1. R およびRStudio のインストール
    2. RStudio 操作の基本
    3. パッケージ利用の準備
    4. プロジェクトの作成とデータ読み込み
    5. データフレームの取り扱い
    6. データの概要の確認
    7. ggplot2
    8. 2 群間の比較
    9. 3 群以上の比較
    10. 重回帰・ロジスティック回帰
    11. 生存時間分析
  • Part 2
    1. データ作成
    2. Rで使うデータ型とデータ構造
    3. 相関係数
    4. ROC曲線

    著者紹介

    笹渕裕介
    自治医科大学データサイエンスセンター 講師
    大野幸子
    東京大学大学院医学系研究科 助手
    石丸美穂
    東京大学大学院医学系研究科
    橋本洋平
    東京大学大学院医学系研究科

    Support & Data

    RおよびRStudioの配布サイト、正誤表などは以下より御覧ください

    RおよびRStudio

    The Comprehensive R Archive Network
    Rの公式サイト。Windows版、MAC OSX版、Linux版各種ダウンロードできる
    RStudio
    本書で取り扱うRStudio desktopバージョンのダウンロードのほか、サーバーサイドバージョン、あるいは有償のサービスも提供している。

    本書で扱ったR scripts

    タイプしてもうまく行かない場合はR Scriptsからご確認ください

    閲覧には、本書4頁のログインID、Passwordが必要となります。

    サンプルデータ

    本書で利用するサンプルデータは以下よりダウンロードできます

    R_book_data.csv

    正誤表

    正誤表(2020.04)をご確認ください。

    Q & A

    パッケージをインストールできない、パッケージのアップデートによる不具合についてどう対策したらいいのかなど、読者から寄せられた質問についての返答集です。

    著者によるセミナーの案内

    著者によるセミナーを案内しています。

    2021年7月17日、zoomによるオンラインセミナーの開催が決定しました。

    お問い合わせ先

    誤字・誤植、あるいはエラーが出て分析ができないという場合はこちらのフォームよりお問い合わせください。

    出版に際し、慎重に確認をしておりますが、パッケージやR本体のバージョンによってはエラーとなる可能性があります。もしエラーについてのお問い合わせの際には、以下の情報を必ずご記入ください

    • Rのバージョン
    • RStudioのバージョン
    • ご利用されているOSとそのバージョン
    • エラーの出ているパッケージのバージョン
    • エラーメッセージ

    *は必須項目となります

    • 金芳堂 連絡先

      〒606-8425
      京都市左京区鹿ケ谷西寺ノ前町34番地
    • 代表電話番号

      075-751-1111
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